175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0053 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  95.08 
 
 		 82 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  95.08 
 
 		 82 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  95.08 
 
 		 82 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  93.44 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  93.44 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  93.44 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  93.44 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0077  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.899895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  86.79 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41320  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73657  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>