299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3566 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  91.03 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  88.71 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  88.71 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  90.38 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309360  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0042  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41320  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73657  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3504  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309184  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0057  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811413  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t52  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329875  normal  0.0339044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0065  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.401468  normal  0.0428865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0042  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>