278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0031 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309184  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 82 bp  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309360  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 85 bp  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 82 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0042  tRNA-Leu  91.57 
 
 		 82 bp  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0025  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0072  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0068  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 81 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0040  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.850401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0004  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309087  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309138  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309179  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>