202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0046 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  93.88 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>