67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0307 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0408  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0089  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000216717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0041  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.913906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.944852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.964381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0087  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0031  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>