48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0030 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  90.57 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000953822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0066  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0635927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0032  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>