140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0066 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  98.04 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  90.74 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  90.74 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  90.74 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  88 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0170  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0635927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>