95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0036 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  94.34 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0077  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.899895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>