69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA_tRNA-Leu-2 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 89 bp  85.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0014  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>