85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0184 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  95.29 
 
 
87 bp  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  95.12 
 
 
82 bp  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  91.86 
 
 
86 bp  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  89.41 
 
 
85 bp  97.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  97.44 
 
 
84 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  85.06 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  87.3 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  93.02 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  97.06 
 
 
89 bp  60  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  96.97 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  96.97 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  96.97 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  87.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  92.31 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  96.77 
 
 
87 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  86.21 
 
 
85 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  85.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  96.67 
 
 
89 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  85.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  90.48 
 
 
84 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  90.48 
 
 
84 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  85.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  85.25 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  84.38 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  93.75 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  93.75 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  93.75 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  93.75 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  83.1 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  83.1 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872486  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0012  tRNA-Leu  93.55 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0538818  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  96.3 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.11 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0052  tRNA-Leu  93.33 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  89.47 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150369  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  83.87 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>