83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_AR0067 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0049  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>