137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0044 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt50  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.916446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0002  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0528002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0026  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000599691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00058  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0071  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0078  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3649  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3481  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3481  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4701  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000616666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5072  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4496  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00806213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3587  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.453688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3470  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00513731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3551  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3660  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0342114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1282  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0033  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735021  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2149  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2227  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0019  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0018  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4277  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3989  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0051  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00811518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0839  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1149  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0634  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.323401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0041  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0074  tRNA-Leu  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0032  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  82.95 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0005  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0007  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0043  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0738  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0135197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1289  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1298  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0023  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0034  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>