139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0032 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0002  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0185  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  100 
 
 		 1389 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>