158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0025 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  89.53 
 
 
86 bp  99.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  95.12 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  97.14 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  92.86 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  96.88 
 
 
86 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  96.67 
 
 
86 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  85.51 
 
 
88 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  90.24 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  93.94 
 
 
82 bp  50.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  90.24 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  91.67 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  91.67 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  89.74 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  91.43 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  91.43 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  93.55 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.18 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>