105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR_t39 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  163  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  163  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  98.78 
 
 		 85 bp  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  131  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  97.01 
 
 		 85 bp  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 87 bp  89.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  88.71 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0899953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>