125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_R0023 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0044  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0839  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1149  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0026  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.44875e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0024  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.622642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0024  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000365355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0034  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0738  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0135197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1289  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1298  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0026  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000599691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0041  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135898  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0056  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>