211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_R0027 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  91.55 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0017  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.344367 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t094  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0128  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000373913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  96.43 
 
 		 1257 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0042  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.574656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0044  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872486  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>