17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0066 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0635927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  96.43 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.43 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  93.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  93.33 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0051  tRNA-Ser  92.11 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  93.33 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  93.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>