133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0026 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04001  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0610  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  82.14 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0535721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>