41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0038 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0052  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0041  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618598  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  84 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  84 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t094  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680861  decreased coverage  0.000577389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0128  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000373913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>