53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0610 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0610  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>