181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0081 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  0.0114921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>