131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0072 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  91.25 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 86 bp  85.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  87.64 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  87.64 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0027  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000316581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239453  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0011  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0694  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.108922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0838  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.30479e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  0.000000000132078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>