103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_R0003 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  92.68 
 
 
82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  94.83 
 
 
82 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0014  tRNA-Leu  95.65 
 
 
84 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061213  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0024  tRNA-Leu  89.06 
 
 
82 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522989  normal  0.148757 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  94.12 
 
 
82 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  96.43 
 
 
1254 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0032  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309098  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  96.43 
 
 
1254 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309130  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  96.43 
 
 
1263 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309210  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  96.43 
 
 
1254 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309171  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.622371  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  96.43 
 
 
1263 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309380  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  100 
 
 
80 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  0.0114921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378994  normal  0.691474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
876 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>