116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_R0030 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0027  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000316581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0057  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0011  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  82.95 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  82.95 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0010  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000723961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0063  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000302371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0694  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.108922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0838  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.30479e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02743  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05676  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05682  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>