178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lppt34 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  95.4 
 
 
87 bp  141  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  88.51 
 
 
85 bp  87.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  88.51 
 
 
87 bp  87.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  88.75 
 
 
87 bp  87.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  87.5 
 
 
87 bp  79.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  87.5 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  88.57 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  97.56 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  97.56 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  97.56 
 
 
86 bp  73.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  97.5 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  93.62 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  95.35 
 
 
88 bp  69.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  93.62 
 
 
92 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  86.52 
 
 
88 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  86.52 
 
 
88 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  86.96 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  93.33 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  86.96 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  95.12 
 
 
89 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  95.12 
 
 
86 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  89.29 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  95 
 
 
88 bp  63.9  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  88.33 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  92.86 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  94.59 
 
 
84 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  86.11 
 
 
89 bp  58  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  92.68 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  82.76 
 
 
87 bp  54  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.67 
 
 
89 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t035  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  96.67 
 
 
86 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t071  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000662467  normal  0.0211471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  84.29 
 
 
86 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118641  hitchhiker  0.00000124407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000189086  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0098  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00669623  hitchhiker  0.0018362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027716  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000116077  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  84.29 
 
 
87 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t066  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000841762  hitchhiker  0.00000000876974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000431173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239453  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000971142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0061  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000343038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0066  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000102831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0067  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000113297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>