161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0033 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 87 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 86 bp  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  91.01 
 
 		 89 bp  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 89 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0027  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000316581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  90.38 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000237414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000361603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000352128  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000136258  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  0.000000000132078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0057  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>