67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0031 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  81.71 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>