119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0037 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  88.73 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  92.31 
 
 
89 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  85.39 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0027  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000316581  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90.38 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  88.33 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.92 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  88.14 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.5 
 
 
89 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  92.5 
 
 
88 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  92.5 
 
 
86 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  92.5 
 
 
89 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  92.5 
 
 
89 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  83.91 
 
 
86 bp  54  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000432662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  84.29 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  94.12 
 
 
88 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  86.36 
 
 
88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  86.36 
 
 
88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000361603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000136258  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  84.06 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  84.06 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  90.24 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000237414  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  84.06 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  84.06 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  84.06 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000352128  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  0.000000000132078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  85 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  85 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0068  tRNA-Leu  90 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0085  tRNA-Leu  90 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196786  normal  0.612491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  90 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  85 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  82.89 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  89.74 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  89.74 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  89.74 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t043  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0060  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000996161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0066  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000463268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118641  hitchhiker  0.00000124407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000189086  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0053  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0072  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.021945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  81.61 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027716  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000116077  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t01  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000431173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0057  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239453  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000971142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02743  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05676  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05682  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0086  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0089  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0093  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0100  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00215722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0102  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0104  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00197165  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0052  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0054  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0058  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29408  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  84.75 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>