134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_R0026 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  96.34 
 
 		 82 bp  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  93.67 
 
 		 85 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  93.67 
 
 		 85 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  92.73 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  90.74 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  93.88 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0049  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0748  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0023  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>