93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4050 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0610  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0457  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.174165  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97423e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522989  normal  0.148757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t094  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0128  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000373913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1619  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0724475  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0544  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>