36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0024 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522989  normal  0.148757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0014  tRNA-Leu  90 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 912 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>