98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0031 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06707  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03400  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0170  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378994  normal  0.691474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3125t  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.556265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>