98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0055 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  81.71 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>