269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0039 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0011  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>