101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_R0046 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.65 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 92 bp  67.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0015  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0041  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0062  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0021  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>