141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0044 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  87.64 
 
 		 89 bp  83.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 86 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0171  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.661922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 86 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4572  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000682737  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0023  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0238053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0103  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000553911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0138  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00946878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4998  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0100  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0047  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0194544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0032  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00166696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0021  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2624  hypothetical protein  96.77 
 
 		 702 bp  54  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.0379727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>