171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 89 bp  87.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  90.74 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 92 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000361603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t035  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t043  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t071  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000662467  normal  0.0211471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118641  hitchhiker  0.00000124407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000189086  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0098  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00669623  hitchhiker  0.0018362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t065  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000716736  hitchhiker  0.00000000861256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t066  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000841762  hitchhiker  0.00000000876974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000136258  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027716  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000116077  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0057  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t01  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000431173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0057  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239453  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000352128  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000237414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000971142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0061  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000343038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0066  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000102831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0067  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>