73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0025 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 85 bp  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 85 bp  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  81.93 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  81.93 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  81.93 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  81.93 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  81.93 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  82.02 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>