181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2330 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 87 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0074  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t071  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000662467  normal  0.0211471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0054  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t035  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t043  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0057  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.428944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0060  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000996161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0066  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000463268  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118641  hitchhiker  0.00000124407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000189086  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0098  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00669623  hitchhiker  0.0018362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0053  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0072  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.021945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0089  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027716  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000116077  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0063  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000302371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0093  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0052  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t01  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000431173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0057  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239453  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000971142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0089  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0061  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000343038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0066  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000102831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0067  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0058  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29408  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0086  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t066  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000841762  hitchhiker  0.00000000876974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>