50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_R0049 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000367535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>