49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0036 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0026  tRNA-Leu  90.62 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>