42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_R0013 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 89 bp  91.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>