147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNALeuVIMSS1309259 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  89.53 
 
 
89 bp  99.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  94.87 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  97.14 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  97.14 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  86.75 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  97.14 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  97.06 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  97.06 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  97.06 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  84.88 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  97.06 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  97.06 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  97.06 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 
84 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  92.31 
 
 
89 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  94.12 
 
 
86 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  94.12 
 
 
88 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  94.12 
 
 
84 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4301  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.640502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0014  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00811405  normal  0.0178437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4968  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000650666  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4807  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000360062  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00783085  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4910  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00037453  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>