64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_R0001 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1413  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.192741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0045  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.612739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0049  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000953822  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0011  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>