100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_R0067 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0015  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0025  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680861  decreased coverage  0.000577389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0046  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000316581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0054  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0058  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29408  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0052  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0010  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t52  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329875  normal  0.0339044 
 
 
-
 
NC_003295  RS04001  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R11  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0060  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000996161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0072  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.021945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0089  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189785  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811413  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0086  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0089  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0093  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.401468  normal  0.0428865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>