19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0003 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0051  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 80 bp  60  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0017  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.344367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0040  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 80 bp  54  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.850401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0008  tRNA-Leu  82.14 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.256754  normal  0.357381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>