45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0052 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0408  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00487683 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>