62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0044 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  98.85 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0026  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000397125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0028  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.249535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07681  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0028  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0027  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.102213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>