46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 
82 bp  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  89.29 
 
 
85 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  89.02 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  89.02 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  86.59 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  86.25 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  86.9 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  84.34 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  85.54 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.97 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  84.42 
 
 
83 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  86.57 
 
 
85 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  90.91 
 
 
85 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  90.91 
 
 
85 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  91.3 
 
 
84 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  89.13 
 
 
88 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  85.37 
 
 
82 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  93.75 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000397125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  91.67 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  93.55 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  93.55 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  89.47 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  96.15 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  93.33 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>